本校は宮崎県と大分県の県境の山間部に位置し、鮎やホタルが生息する清流に囲まれた自然豊かな地域にあります。周囲の野山には四季折々の花が咲き、ウグイスやメジロなどの野鳥やシカやサル、ウサギなどの生物もたくさん生息しています。また、夜には満天の星空を眺めることができます。このような美しい、自然を守るために、ホタルの観測（３７年間）や三川内河川大清掃（MKD作戦：１７年間）が行われ、地域一丸となって、様々な環境保護活動を続けています。